Статьи в рецензируемых журналах
1. Поливанова Н.Н., Глущенко Ю.Н. Гнездование ходулочника на озере Ханка // Бюллетень МОИП. Отдел. биол. М., 1979, т.84, №3. С. 85–87.
2. Бочарников В.Н., Глущенко Ю.Н., Качур А.Н. Биоразнообразие российского и китайского секторов бассейна озера Ханка // Вестник ДВО РАН, № 4, 2001. С. 23-32.
3. Липатова Н.Н., Глущенко Ю.Н., Мартыненко А.Б. Фауна и население птиц города Уссурийска (Приморский край) // Известия ВУЗов. Северо-Кавказский регион. Естественные науки, 2007. № 4. С. 70-74.
4. Липатова Н.Н., Глущенко Ю.Н., Мартыненко А.Б. Пространственно-временная динамика населения птиц города Уссурийска (Приморский край) // Известия ВУЗов. Северо-Кавказский регион. Естественные науки, 2007. № 5. С. 64-71.
5. Липатова Н.Н., Глущенко Ю.Н., Мартыненко А.Б. Некоторые экологические аспекты населения птиц города Уссурийска (Приморский край) // Вестник БГУ, 2007. Вып. 9. С. 274-279.
6. Коробов Д.В., Глущенко Ю.Н., Бочарников В.Н. Количественные характеристики и особенности миграции клоктуна (Аnas formosa) на Ханкайско-Раздольненской равнине // Вестник Оренбургского государственного университета. № 10, 2007. С. 139-146.
7. Кальницкая И.Н., Глущенко Ю.Н., Сурмач С.Г. Чёрный гриф Aegypius monachus в Приморском крае и экологические предпосылки его массовой гибели // Вестник Оренбургского государственного университета. № 12, 2007. С. 34-39.
8. Глущенко Ю.Н., Кальницкая И.Н., Коробов Д.В. Население птиц бассейна нижнего течения р. Гастелловка (Центральный Сахалин) // Амурский зоологический журнал II (4), 2010. С. 350-362.
9. Глущенко Ю.Н., Волковская-Курдюкова Е.А., Коробов Д.В., Кальницкая И.Н. Материалы к изучению фауны и населения птиц китайского сектора бассейна озера Ханка // Амурский зоологический журнал II (4), 2010. С. 368-377.
10. Глущенко Ю.Н., Коробов Д.В., Кальницкая И.Н. Динамика популяции хохотуньи (Larus cachinnans, Laridae, Aves) на озере Ханка и некоторые черты её биологии // Амурский зоологический журнал III (4), 2011. С. 388-390.
11. Глущенко Ю.Н., Кальницкая И.Н., Коробов Д.В. Птицы лунско-набильского сектора Северо-восточного Сахалина. Сообщение 1. Фоновое население // Амурский зоологический журнал IV(I), 2012. С. 83-96.
12. Глущенко Ю.Н., Кальницкая И.Н., Коробов Д.В. Птицы лунско-набильского сектора Северо-восточного Сахалина. Сообщение 2. Редкие виды // Амурский зоологический журнал IV(2), 2012. С. 184-193.
13. Глущенко Ю.Н., Ли Сяомин, Коробов Д.В., Волковская-Курдюкова Е.А., Кальницкая И.Н., Лю Хуа Цзинь, Ван Фэнкунь, Юй Веньтао. Учёты птиц в китайском национальном парке «Синкай-Ху» в 2011-2012 гг. и некоторые итоги авифаунистических исследований в бассейне озера Ханка // Амурский зоологический журнал IV (3), 2012. С. 288-303.
14. Глущенко Ю.Н., Елсуков С.В., Катин И.О., Нечаев В.А., Харченко В.А., Шибнев Ю.Б., Шохрин В.П. Авифаунистические списки и краткая история изучения птиц заповедников Приморского края // Амурский зоологический журнал V(1), 2013. С. 56-88.
15. Бочарников В.Н., Нечаев В.А., Глущенко Ю.Н. Пятьдесят лет международного изучения и охраны птиц российского Дальнего Востока // Вестник ДВО РАН, 2014. № 3. С. 110-127.
16. Глущенко Ю.Н., Коробов Д.В. Первая в России находка питты-нимфы - Pitta nympha Temminck et Schlegel, 1850 зарегистрирована в Дальневосточном морском заповеднике // Биота и среда заповедников Дальнего Востока. № 5. Владивосток, 2015. С. 4-10.
17. Глущенко Ю.Н., Коробов Д.В. Второй для Дальнего Востока России случай встречи конька Годлевского Anthus godlewskii (Taczanowski, 1876) в Дальневосточном морском заповеднике // Биота и среда заповедников Дальнего Востока. № 5. Владивосток, 2015. С. 11-16.
18. Глущенко Ю.Н. Сизая овсянка Ocyris variabilis (Temminck, 1836): место в таксономической системе семейства Emberizidae и новая встреча в Приморском крае // Биота и среда заповедников Дальнего Востока. № 5. Владивосток, 2015. С. 17-21.
19. Глущенко Ю.Н., Коробов Д.В. Новые данные к изучению орнитофауны Дальневосточного морского заповедника // Биота и среда заповедников Дальнего Востока. № 5. Владивосток, 2015. С. 22-45.
20. Бочарников В.Н., Глущенко Ю.Н., Михайлов К.Е., Егидарев Е.Г. Национальный парк "Бикин" // Биота и среда заповедников Дальнего Востока = Biodiversity and Environment of Far East Reserves. 2016. № 1. С. 3-24.
21. Глущенко Ю.Н., Шибнев Ю.Б. Михайлов К.Е., Коблик Е.А., Бочарников В.Н. Краткий обзор фауны птиц национального парка "Бикин" // Биота и среда заповедников Дальнего Востока = Biodiversity and Environment of Far East Reserves. 2016. № 1. С. 59-139.
22. Скопин А.Е., Глущенко Ю.Н. Биосферный резерват «Озеро Инле» (Восточная Мьянма) // Биота и среда заповедников Дальнего Востока = Biodiversity and Environment of Far East Reserves. 2016. № 2. С. 4-16.
23. Глущенко Ю.Н., Скопин А.Е., Сотников В.Н., Гильмудинов Р.Х. К изучению фауны и населения птиц биосферного резервата «Озеро Инле», Восточная Мьянма // Биота и среда заповедников Дальнего Востока = Biodiversity and Environment of Far East Reserves. 2016. № 2. С. 17-31.
24. Глущенко Ю.Н., Трухин А.М. Два новых вида птиц в фауне Дальневосточного морского заповедника // Биота и среда заповедников Дальнего Востока = Biodiversity and Environment of Far East Reserves. 2016. № 2. С. 146-148.
25. Бочарников В.Н., Токранов А.М., Глущенко Ю.Н. Биоразнообразие и редкие виды наземных и морских животных прибрежно-морской территории Тихоокеанской России // Использование и охрана природных ресурсов России, 2017, № 3. С. 44-50; № 4. С. 39-45.
26. Маркова Т.О., Мрикот А.К., Глущенко Ю.Н. К методам изучения гнездования дальневосточного аиста Ciconia boyciana Swinhoe, 1873 для студентов биологических специальностей высшей школы // Вестник Оренбургского государственного университета, 2018. № 6 (218). С. 32-36.
27. Глущенко Ю.Н., Беляев Д.А., Коробов Д.В. Зимнее гнездование скального голубя Columba rupestris в Приморском крае // Амурский зоологический журнал, 2019, том XI, № 1. С. 78-83.
28. Беляев Д.А., Глущенко Ю.Н., Коробов Д.В., Тиунов И.М. Птицы бассейна верхнего течения р. Грязная (национальный парк "Земля леопарда") // Биота и среда заповедных территорий, 2019. № 4. С. 65-85.
29. Беляев Д.А., Глущенко Ю.Н., Горбуля А.А. Гибель птиц в Уссурийске (Приморский край) от столкновения с оконными стёклами // Амурский зоологический журнал, 2020, т. XII, №. 1. С. 71-79.
Монографии, разделы в монографиях
1. Редкие позвоночные животные советского Дальнего Востока и их охрана (ответственный редактор П.А. Лер). Л.: Наука, 1989. 239 с.
2. Бикин: опыт комплексной оценки природных условий, биоразнообразия и ресурсов. Владивосток: Дальнаука, 1997. 156 с. (соавторы Бочарников В.Н., Розенберг В.А., Ермошин В.В. и др.).
3. Биоразнообразие Дальневосточного экорегионального комплекса. Владивосток: Апельсин, 2004. 188 с. (соавторы Бочарников В.Н., Мартыненко А.Б. и др.).
4. Водно-болотные угодья России. Том 5. Водно-болотные угодья юга Дальнего Востока России. М.: WetlandsInternational, 2005. 220 c (cоавторы Бочарников В.Н., Мартыненко А.Б., Дарман Ю.А. и др.).
5. Стрельцов А.Н., Глущенко Ю.Н. Семейство Papilionidae – Парусники // Определитель насекомых Дальнего Востока России. Т. V. Ручейники и чешуекрылые. Ч. 5. Владивосток: Дальнаука, 2005. С. 188-207.
6. Глущенко Ю.Н., Липатова Н.Н., Мартыненко А.Б. Птицы города Уссурийска: фауна и динамика населения. Владивосток, 2006. 264 с.
7. Позвоночные животные заповедника «Ханкайский» и Приханкайской низменности: монография. (Ответственный редактор А.А. Назаренко). Владивосток, 2006. 305 с.
8. Геосистемы Дальнего Востока России на рубеже XX-XXI веков: в 3 т. колл. авторов; ред. С.С. Ганзей; под общ. ред. ак. Бакланова П.Я. Глава 9. Животный мир: суша и континентальные водоёмы. Владивосток: Дальнаука, 2008. (соавторы Мартыненко А.Б., Бочарников В.Н., Пикунов Д.Г., и др.).
9. Птицы России и сопредельных регионов: Пеликанообразные, Аистообразные, Фламингообразные. (Многотомная сводка; коллектив авторов). М.: Товарищество научных изданий КМК, 2011. 602 с.
10. Глущенко Ю.Н., Нечаев В.А., Редькин Я.А. Птицы Приморского края: краткий фаунистический обзор. М.: Товарищество научных изданий КМК, 2016. 523 с.
11. Коляда А.С., Глущенко Ю.Н. (ред.). Природный комплекс Уссурийского городского округа; современное состояние. Владивосток: ДВФУ, 2019. 497 с.